万历帝着急的拍拍大腿说道：“这一点朕知道，爱妃赶紧说别的！”
郑贵妃安抚的摸摸万历帝的手臂说道：“现在其实对万岁爷威胁最大的就是武国公手下的锦衣卫和新军。臣妾的意思把武国公和他们分割开来。就是说将新军划归陛下直接掌握，选一些听话的人去领军，不要求他们能打仗，只要求他们能够日常训练好士兵就可以了。如果真的打仗的时候直接安排武国公领军。另外就是锦衣卫了、武国公执掌锦衣卫多年，给锦衣卫留下的烙印太深刻了！所以锦衣卫也应当交给其他人管辖，但是要听武国公调度。只要这么隔了一层，就能确保武国公的手下不至于造反，而且还能让武国公继续给陛下出谋划策，继续给陛下办差！虽然说是权势损失了一些，但是陛下完全可以通过其他方式补偿啊！”
万历帝越听越感兴趣，越听眼睛睁得越大！等郑贵妃说完之后再次开始帮他削水果的时候，他一直在盯着果盘儿沉思。直到良久之后他突然说了一句：“锦衣卫还好说，交给旁人就是坏也不会坏到哪里去！可是新军不同，若是交到不当的人手里，这军队就毁了！”
郑贵妃抿嘴一笑说道：“陛下可以重新成立五军都督府啊！之后就可以通过都督府来掌握新军，督促他们练兵。反正到时候万岁爷拿着新军的规章制度去检查就是了，不行咱们就换人！”
万历帝到这里一拍大腿说道：“爱妃呀，你真是朕的诸葛亮啊！果然是个好主意啊！”
五军都督府的出现是明朝建立之前，朱元璋设置的军队领导机构，其最早的名称为大都督府。其设置的目的就是为了由朱元璋本人加强对军队的掌控。
明朝建立后，朱元璋的中央政府设置有兵部，这是沿袭前朝的自然产物。而大都督府作为明帝国建立前，朱元璋在创业时期特有的军队领导机构也自然成为明帝国国家的军队领导机关，这就让明帝国出现了兵部和五军都督府两个军队领导机构同时并存的“奇特现象”。
于是在废掉宰相制度，朱元璋把大都督府改为五军都督府。五军都督府在明帝国建立后，成为朱元璋皇权扩张的手段之一。
明朝这个朝代，是中国专制皇权走向全面集中的重要转折点。为了树立皇帝对军队和政治力量的掌控，朱元璋对明朝中央体系做出了一系列改革。自从朱元璋亲自废除了中书省，丞相制度被明朝废除。这等于朱元璋实现了对明帝国行政的绝对控制，明帝国六部都由皇帝亲自领导。
所以朱元璋让五军都督府和兵部同时存在，
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